我國科學家揭示肝癌分子特征全景




 
我國科學家揭示肝癌分子特征全景  
 

本報訊(記者黃辛)中國科學院院士、復旦大學(中山醫院)肝癌研究所教授樊嘉等借助大規模的蛋白質基因組平臺,首次實現了對乙肝相關肝癌的系統性分析,為更深入地探索肝癌發生發展機制及指導肝癌的個體化精準診療帶來了新希望。該成果近日在線發表于《細胞》。

樊嘉等通過與中科院上海藥物研究所研究員周虎及中科院生物化學與細胞生物學研究所研究員高大明研究組合作,利用159例手術切除的肝癌樣本,全面檢測和分析了基因突變譜、拷貝數變異、表達譜、蛋白質組及磷酸化蛋白質組,通過關聯分析與生物學實驗,全面解析了肝癌分子特征和發生發展的機制,揭示了我國肝癌突變譜與西方肝癌突變譜的不同,提示了基于中國人肝癌數據開展臨床轉化研究的必要性。

據樊嘉介紹,我國相當一部分乙肝患者曾接受中醫藥治療,中藥的不當使用與肝癌的發生發展具有一定的相關性。研究人員發現,35%的肝癌樣本中含有馬兜鈴酸誘導的基因突變“指紋”,同時,蛋白質組數據也檢測到了由馬兜鈴酸基因突變“指紋”編碼的變異蛋白。馬兜鈴酸的突變“指紋”與腫瘤突變負荷、腫瘤新抗原、微環境免疫耐受顯著相關,提示免疫治療對該類肝癌患者的潛在臨床價值。他們還發現,肝癌mRNA表達和蛋白表達的相關性僅為0.54,約20%蛋白質對基因拷貝數變異產生了顯著的對沖效應。

該研究還系統提示了代謝異常在肝癌發生發展中的重要作用,發現代謝相關蛋白質的變化是肝癌和非肝癌組織最大的差異,并與有無“門靜脈癌栓”這一肝癌特殊的臨床特征密切相關。




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