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淺談核酸染料,最佳EB替代品



對于這個問題,實驗室一直在討論,各種核酸染料各有優缺,到底應該選擇哪一個實在是個讓人頭疼的問題!

因為工作需要,我們室的核酸電泳量相當巨大,每天都要不停的跑啊跑。。所以對這個EB替代品問題就比較關心,基本上市面上的所有核酸染料都買來試過了。

其實做核酸電泳 替代EB的主要原因無非兩條:
1 保證對身體低危害;
2 在不影響EB的效果的前提下,可以更加穩定,敏感度更高,以適應高精確度的實驗

以這兩條原則為準繩,我們做到現在,只有兩個產品可以達到 sybr green ,和 gelred
無論是危害性,實驗效果都可以達到要求。
但是鑒于實驗室已經被污染,并且這兩個產品的價格要比EB高出許多,所以現在仍然在使用EB。
想立刻更換EB替代品,希望大家根據自己的經驗,給些建議,師弟在此不勝感激!

補充一個小知識,AO又稱丫叮橙,劇毒致癌物質,也可以做DNA和RNA電泳。它在做雙鏈DNA電泳時呈現綠色熒光,單鏈則為紅色熒光。

現在有不少國內EB替代品就是用AO(丫叮橙)為原料,實驗效果雖然不如EB,這個暫且放在一邊不說,就是毒性也夠嚇人的!無是從健康角度還是實驗效果而言都無法與EB媲美!
希望大家謹慎選擇,劇我所知,國內的EB替代品,核酸染料全是用AO丫叮橙調制!

因為所有的染料我都用過,這些國內的EB替代品,它們跟AO丫叮橙的實驗結果驚人的相似!大家不妨都拿來試用一下看看結果。

在毒性認證這方面我可以說我們應該很重洋媚外!

沒有人愿意拿自己5年甚至10以后的身體健康來做賭注

我們實驗室剛用sybr green 替代EB,可能是剛用條件不是摸的透徹,跑出的不如EB漂亮。
請問你們使用sybr green 的步驟?
不是要預染10MIN,染長時間有影響嗎?
實驗室開空調,是否影響膠濃縮時間?

是不如eb漂亮,有時候還不準,跑一組,條帶都成鋸齒了,不過比EB敏感多了,用核酸染料染的也可以用凝膠成像儀看,也可以拍,

電壓越高,條帶越亂,有時候會誤認為是非特異性擴增,后又跑下EB,發現是目的條帶,現在還沒想出為什么.

不同公司的sybr現在效果差別很大!產品相當亂。
建議大家可以試試 gelred ,各方面效果都很出色,還可以免費試用的,不過不知道現在還發不發免費裝


biospace wrote:
補充一個小知識,AO又稱丫叮橙,劇毒致癌物質,也可以做DNA和RNA電泳。它在做雙鏈DNA電泳時呈現綠色熒光,單鏈則為紅色熒光。

現在有不少國內EB替代品就是用AO(丫叮橙)為原料,實驗效果雖然不如EB,這個暫且放在一邊不說,就是毒性也夠嚇人的!無是從健康角度還是實驗效果而言都無法與EB媲美!
希望大家謹慎選擇,劇我所知,國內的EB替代品,核酸染料全是用AO丫叮橙調制!

因為所有的染料我都用過,這些國內的EB替代品,它們跟AO丫叮橙的實驗結果驚人的相似!大家不妨都拿來試用一下看看結果。

在毒性認證這方面我可以說我們應該很重洋媚外!

沒有人愿意拿自己5年甚至10以后的身體健康來做賭注


看來以后接觸goldiew還是小心點好
Gelred是哪家公司買呢?價格多少?

天根又推出了一個叫GeneGreen的染料,說是屬于花青類染料,比EB毒性低,無致癌性,靈敏度比EB高10倍.紫外發射綠色熒光.拿了個試用裝.不知道是不是樓上所說的AO(丫叮橙)?
gelred價格是很高啊,將近一千塊了.

只要有上邊所說的那個特性就應該是丫叮橙了,所以建議大家謹慎操作
gelred價格是比較高的,奢侈的實驗室才用的起了,不過送我們的試用裝還沒用完呢

請問樓上是在哪申請的試用裝?


很久以前的活動了,你自己找找看吧

做電泳這么多年,其實還是EB最好,沒毒就完美了

強力推薦大家使用gelred,效果沒的說,另外我看了報價,竟然比美金報價格還便宜,相當劃算的EB替代品

記得我們實驗室用過賽百盛,跑的效果還是不錯的。染DNA是綠色熒光,不知道和上面說的是不是一樣的東西,我只知道商品名,呵呵

我剛到實驗室不久,聽說是用一種叫"GENEFINDER"的EB替代品,不知道和以上大家說的有無聯系,要是也有毒性的話我以后可要小心了.

我現在還是從goldiew用回EB了.沒辦法啊,EB靈敏度高而且便宜.安全自己多注意了,戴兩層一次手套和一層橡膠手套可以了吧.

其實我覺得核酸染料最好還是不要直接接觸,不管現在有毒還是沒毒的.
因為從目前核酸染料的原理來講,都是插入DNA,被剛性力束縛.當一定波長的光誘導以后,無法通過基團旋轉來釋放多余能量,只能通過電子的躍遷來平衡,所以發出熒光.
還是少直接接觸的好.

The effectie ingredient in Goldiew is acridine orange (extremely cheap from Aldrich or Sigma at ~100g/$140!)
Acridine orange is a known gel stain since 1970s (“Analysis of single- and double-stranded nucleic acids on polyacrylamide and agarose gels by using glyoxal and acridine orange”. Proc Natl Acad Sci U S A. 1977 No;74(11):4835-8.
Acridine orange is a highly toxic and known mutagen!

Selected list of papers on acridine orange toxicity:
Web, RB. Mutat Res. 1984 Jul;137(1):1-6.
Wugmeister, M. Yale J Biol Med. 1983 Jan-Feb;56(1):9-13.
Martin, SE. Mutat Res. 1981 Jun;82(1):41-6.
Ashad, R. Letters in Applied Microbiology 2006, 42:94.

goldiew ,genefinder等這些染料其實都是上邊所說的 acridine orange (丫啶橙),毒性很大,如果大家現在用的是這兩種東西就建議還是換回eb吧??!
現在已經真相大白,

建議不要再為節省那點銀子而做無畏的犧牲了??!

只要有上邊所說的那個特性就應該是丫叮橙了,所以建議大家謹慎操作
gelred價格是比較高的,奢侈的實驗室才用的起了,不過送我們的試用裝還沒用完呢

請問是哪個特性啊

只要有上邊所說的那個特性就應該是丫叮橙了,所以建議大家謹慎操作
gelred價格是比較高的,奢侈的實驗室才用的起了,不過送我們的試用裝還沒用完呢

請問是哪個特性啊

這個特性:
它在做雙鏈DNA電泳時呈現綠色熒光,單鏈則為紅色熒光

還想關注這個問題

賽百盛公司的Goldiew核酸染料,說明書上寫的是沒有毒害,我們實驗室一直在用,效果還是不錯的。

別用Goldiew了,劇毒?。?!強烈推薦gelred,如果不是價格問題就買吧,我有個導師剛從美國回來,那邊做課題基本都在用gelred出的結果了,效果非常好,至于毒性,大家就擦亮雙眼吧,這些尖端的東西還是重洋點好,畢竟老美在環保這方面可是比我們要重視的多的

GelRed的確比較不錯。

我這里有翻譯的中文說明書,感興趣的可以看看。

GelRed核酸凝膠染色劑中文說明書(把@換成.):



是不是丫錠橙跑個電泳就知道了,丫錠橙染色效果不如EB的,目前比EB好的熒光染料的毒型都低得多,比如GELRED,GELGREEN,SYBR?。牵遥牛牛?,GENESEARCH,

我們實驗室用的是Gelred的,還是在我的極力推薦下替換的,老板也很爽快,竟然一下子就答應了,呵呵!
是上海開放公司代理的,其它地方有辦事處,可以直接聯系的。
500ul大概850左右,買多還可以講講價格的??梢耘菽z,液可以直接加在膠里。
我們一般都是泡膠的,效果很好!和eb泡膠一樣方便,且穩定性要比eb好,不用擔心分解的。

***新出了一款花箐核酸染料,價格不錯,比EB敏感,挺合適的
首頁有介紹


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