HIV-1B的分析揭示了該病毒的傳播動態



在印度尼西亞,對HIV-1B病毒的分子系統發育(進化史)的研究成功地闡明了三個進化枝(病毒的主要分支)的傳播時期和途徑。其中包括一個印尼獨有的進化枝,以及在1970年代和1980年代從泰國,歐洲和美國傳播的進化枝。

HIV-1B的分析揭示了該病毒的傳播動態

在AMED的J-GRID計劃的資助下,神戶大學與印度尼西亞的Airlangga大學之間的研究合作使這項研究成為可能(請參見致謝)。該小組由神岡正典教授和神木大學大學院醫學研究科公共衛生學系助理教授Assistant木智宏教授,上田樹平研究助理(神戶大學醫學研究生院傳染病研究中心),納斯魯努丁教授組成(Airlangga大學)和大阪公共衛生研究所的元村一志博士。

這些結果已于2019年9月27日發表在國際期刊《科學報告》上。

介紹

HIV(人類免疫缺陷病毒)發展為AIDS(后天免疫缺陷綜合癥),自1981年發現第一例病例以來,它仍然是主要的健康威脅。

HIV的基因組成很容易適應和變化。例如。HIV-1 M(主要)是世界上傳播最廣泛的HIV類型,僅就HIV-1 M而言,其9個亞型中就有100株以上。

人們認為,HIV-1的B型亞型(HIV-1B)起源于中非的剛果民主共和國,并從那里傳播到海地和美國。隨后,它被傳播到歐洲和亞洲,現在遍布全球。

印度尼西亞由17,500多個島嶼組成,擁有世界第四大人口。它還以東南亞地區HIV傳播最多的案例,其中以CRF01_AE形式為主要亞型。HIV-1 B亞型(HIV-1B)也很普遍。盡管印度尼西亞的感染率一直在下降,但仍然是一個重大的公共衛生問題。但是,關于印尼病毒的起源,傳播和進化的許多方面,人們還不甚了解。

方法

為了進行這項研究,從印度尼西亞爪哇,蘇門答臘,巴布亞,蘇拉威西島和其他各個主要島嶼的醫療機構的艾滋病毒患者那里采集了外周血樣本。鑒定了HIV-1B基因的32個序列。然后使用密切相關的HIV-1B序列數據庫分析這些基因的進化。這些系統發育分析表明,印度尼西亞HIV-1B的主要類型是印度尼西亞進化枝,其次是中國和美國進化枝。

隨后對這三個進化枝的分子系統發育進行了深入分析,揭示了它們可能是如何到達印度尼西亞的。結果表明印尼進化枝起源于美國。在1980年代后半葉到達印度尼西亞后,人們認為它已發展成印度尼西亞的獨特菌株。中國的進化枝在80年代末從泰國傳??播開來,而美國的進化枝則在80年代中期通過歐洲傳播(圖1)??傮w而言,研究發現,整個1970年代和1980年代,HIV-1B是通過泰國,歐洲和美國多次傳入印度尼西亞的(估計最早的病毒引進是在1961年左右)。




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