新突破!滬專家:中國肝癌突變譜與西方不同,



原標題:新突破!滬專家:中國肝癌突變譜與西方不同,患者分三個亞型

中國約85%的肝癌患者有乙肝病毒感染背景,乙肝相關肝癌研究近日迎來了新突破。

新突破!滬專家:中國肝癌突變譜與西方不同,

復旦大學附屬中山醫院樊嘉院士團隊部分成員。中山醫院供圖

2019年10月3日,國際頂級生物醫學期刊《細胞》(《CELL》)在線發表了復旦大學附屬中山醫院樊嘉院士團隊的最新成果“乙肝相關肝細胞癌的整合蛋白質基因組學特征”。

該研究借助大規模的蛋白質基因組平臺,以高質量的蛋白質組學技術為基礎,充分結合基因組和轉錄組學研究,首次實現了對乙肝相關肝癌的多組學、多層次、多維度的系統性分析,為更深入地探索肝癌發生發展機制及指導肝癌的個體化精準診療帶來了新的希望。

10月9日,澎湃新聞()記者從中山醫院獲悉,這項研究利用159例手術切除的肝癌樣本,全面檢測和分析了基因突變譜、拷貝數變異、表達譜、蛋白質組及磷酸化蛋白質組,通過關聯分析與生物學實驗,全面解析了肝癌分子特征和發生發展的機制,首次揭示了中國肝癌突變譜與西方肝癌突變譜的不同之處。

研究表明,肝癌患者可分為三個亞型,即代謝驅動型、微環境失調型和增殖驅動型。

這三個亞型患者的臨床預后和潛在治療靶點顯著不同,其中代謝驅動型療效最樂觀、增殖驅動型療效最不理想,預后也最差。而且,這種分子分型的預后價值甚至超過了臨床上常用TNM分期,有望為肝癌的預后判斷、分子分型和個性化治療提供精準指導。

值得注意的是,中國相當一部分乙肝患者曾接受過中醫藥治療,而中藥的不當使用與肝癌的發生發展具有一定的相關性。

此次研究發現,35%的肝癌樣本中含有馬兜鈴酸誘導的基因突變“指紋”,同時,蛋白質組數據也檢測到了由馬兜鈴酸基因突變“指紋”編碼的變異蛋白,而且馬兜鈴酸的突變“指紋”與腫瘤突變負荷(TMB)增高和微環境免疫耐受顯著相關,提示了免疫治療對該類肝癌患者的潛在臨床價值。

因此,研究建議在臨床上應謹慎使用含有馬兜鈴酸的中草藥。

除此之外,研究還發現,肝癌mRNA表達和蛋白表達的相關性僅為0.54,約20%蛋白質對基因拷貝數變異產生了顯著的對沖效應,既對多組學數據之間的不一致提出了可能的解釋,又證明了多組學聯合分析的科學價值。

肝臟是人體最主要的代謝器官,擔負著生物轉化、合成、解毒等重要功能,該研究系統地提示了代謝異常在肝癌發生發展中的重要作用,發現代謝相關蛋白質的變化是肝癌和非肝癌組織最大的差異,并與有無“門靜脈癌栓”這一肝癌特殊的臨床特征密切相關。




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