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中國科學家完成小豆基因組測序與菜豆是近親



人民網北京10月13日電(趙竹青)小豆作為古老栽培作物起源于中國,在全世界30多個國家和地區種植,被廣泛用于食品及保健品中。日前,由北京農學院萬平教授與中國科學院遺傳與發育生物學研究所凌宏清和田志喜研究員領銜的研究團隊與深圳華大基因研究院合作,完成了小豆全基因組測序。

該團隊利用第二代測序技術對小豆全基因組進行鳥槍法測序,獲得了90.88 Gb有效序列。通過這些測序結果,并與已知豆科植物的基因組比較及共線性分析,證實小豆與菜豆親緣關系最近。另外還解析了小豆和大豆籽粒中淀粉和脂肪積累差異,不是由淀粉和油脂合成相關基因數目變化引起,而是由這些基因的轉錄表達量所導致。

小豆基因組測序的完成,將促進小豆重要農藝性狀基因的鑒定與克隆和分子育種,提升中國小豆的研究水平。獲得的基因組信息為比較基因組學研究提供豐富的數據資源,也有助于豆科物種進化和馴化關系研究,解析豆類植物在長期進化過程中代謝差異形成的分子機制。

該研究成果于2015年10月12號在美國科學院院報PNAS雜志在線發表。北京農學院的楊凱教授、中國科學院遺傳與發育生物學研究所的田志喜研究員、華大基因研究院的陳春海和羅龍海為共同第一作者,北京農學院的萬平教授、中國科學院遺傳與發育生物學研究所的凌宏清研究員、華大基因研究院的王俊研究員以及國際半干旱作物研究所的Rajeev K. Varshney博士為共同通訊作者。該項目受到北京市教委基礎研究與技術創新項目和國家自然科學基金委項目的支持。




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