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中科院廣州生物院開發RICK技術首次分離RNA結合蛋白



中科院廣州生物院開發RICK技術首次分離RNA結合蛋白

RICK技術原理圖。

科學網廣州2月13日訊 記者從中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院獲悉,該院研究員米格爾?埃斯特班、張必良和副研究員鮑習琛領銜的科研團隊開發RICK技術首次分離RNA結合蛋白。該技術是全面分析細胞內的RNA-蛋白相互作用的重要工具,有助于揭開基因組中的“暗物質”-非編碼RNA的未知功能。相關研究2月13日在線發表在《自然-方法學》。

有數以百計的蛋白質可以與RNA結合,其中很多涉及神經退行性病變、自身免疫缺陷和癌癥等疾病。那么,如何系統地分離RNA結合蛋白的問題變得引人注目。前期科學家們系統地分離了細胞內mRNA結合蛋白,這只是眾多轉錄本中的一部分,細胞還包含了很多非polyA RNA。

研究人員設計了RICK(Newly Transcribed RNA interactome using click chemistry)技術,利用核酸標記技術,巧妙地將新合成的RNA標記上生物素,通過鏈霉親和素偶聯的磁珠,分離得到相應被標記RNA分子和與其相結合的蛋白分子。通過這一技術,研究人員系統地分離了包括非polyA尾RNA和新生RNA在內的一系列RNA分子及其結合蛋白。

進一步分析發現,細胞分裂調控因子作為新的RNA結合蛋白,存在結合非polyA尾RNA的潛能。研究人員縮短標記的時間,成功地在細胞中分離了新生RNA結合蛋白。這些蛋白與新生RNA的轉錄及后續的加工、剪切等調控密切相關。這一技術的應用將有助于深入地剖析RNA結合蛋白的作用機制,也是細胞命運轉變過程中分析RNA蛋白相互作用的重要工具。




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